Nesta sexta fase o programa surge com uma dotação de 10 milhões de euros destinados a contemplar candidaturas que foram aprovadas mas não seleccionadas nas fases anteriores.O incentivo financeiro do MODCOM a micro, pequenas e médias empresas contempla apoios a três tipos de acções de que se destaca a Acção A para lojas individuais e conjuntos de modernização comercial; Acção B para lojas em rede, ou seja, empresas que pretendam, por exemplo, adoptar uma insígnia comum ainda que a propriedade seja individual, que utilizem a mesma plataforma informática ou que se abasteçam na mesma central de compras e uma terceira acção (c) destinada a estruturas associativas do sector do comércio, com vista à promoção dos centros urbanos.
Os projectos de investimento contarão com uma taxa de incentivo a fundo perdido de 45 por cento das despesas no caso das lojas individuais, de 5º por cento nos projectos empresariais integrados e de 6º por cento para as associações comerciais.
Nas cinco fases anteriores do MODCOM o Governo disponibilizou um total de 134 milhões de euros a fundo perdido para a revitalização do comércio tradicional, tendo sido seleccionados cerca de 4.600 projectos empresariais e associativos. Os postos de trabalho resultantes deste investimento foram mais de 7.000 mil.